Для медицинских целей используют траву, цветки и корневища растения.
Настой корневищ сабельника пьют при поносе, простуде, для остановки кровотечений.
Отвар корневищ применяется при ревматизме, для заживления ран.
Отваром травы с корнями (столовая ложка на на стакан кипятка) полощут рот при зубной боли и воспалении десен.